Program Plava zastavica se odvija u dva nivoa, a prije nego jedno kupalište ili marina postane član ovog prestižnog kluba, mora da prodje pilot fazu, koja od 2013. traje dvije godine.
Ove sezone tu je 14 pilot kupališta: “Dobreč” na Luštici, “Moet & Shandon beach“, Guvance; hotel “Mediteran”, “Sveti Toma 2” i “Olympic” u Bečićima, hotel “Maestral”, Pržno, “La Sauerte”, Kamenovo; “Korali 2“ i “Cuba libre”, Sutomore; “Aquarius”, Borova šuma te “As Saranda”, “Barbossa beach”, “Hills beach” i “Havana beach” na Velikoj plaži.